Macintosh SE FDHD, uvedený v roce 1989, byl vylepšenou verzí populárního Macintosh SE a jedním z prvních modelů, který podporoval diskety o kapacitě 1,4 MB (floppy disk high-density, nebo FDHD), což znamenalo větší kapacitu než předchozí modely. Tento model byl vybaven procesorem Motorola 68000 na frekvenci 8 MHz, měl 1 MB RAM (rozšiřitelnou na 4 MB) a pevný disk o kapacitě až 40 MB.

Macintosh SE FDHD měl 9palcový monochromatický CRT displej s rozlišením 512×342 pixelů a běžel na Mac OS 6, což poskytovalo uživatelsky přívětivé prostředí pro kancelářské aplikace, grafiku a školní použití. Vylepšení ve formě rozšířené diskové kapacity a možnosti připojení externího SCSI zařízení znamenala, že tento model byl flexibilnější a výkonnější než předchozí počítače.

Macintosh SE FDHD byl oblíbený pro svou kompaktní velikost a spolehlivost a byl široce používán v kancelářích, školách a malých firmách. I když nebyl tak revoluční jako některé jiné modely, přinesl důležité technologické zlepšení, která zvýšila produktivitu a použitelnost. Model byl vyráběn až do 1990, kdy ho nahradily novější modely Macintosh.