Macintosh IIsi, uvedený v roce 1990, byl navržen jako cenově dostupnější varianta výkonnějšího modelu IIci, přičemž si zachoval kompatibilitu s většinou jeho rozšiřujících karet. IIsi používal procesor Motorola 68030 na frekvenci 20 MHz, což poskytovalo solidní výkon pro tehdejší kancelářské i grafické aplikace. Standardně byl dodáván s 1 MB RAM, kterou bylo možné rozšířit až na 65 MB pomocí SIMM modulů.

Počítač měl kompaktní desktopové šasi, odlišné od typické „pizza box“ konstrukce vyšších modelů řady Macintosh II. Disponoval jedním NuBus slotem (přístupným přes volitelný adaptér) a měl vestavěný zvukový výstup, který nahradil dřívější jednoduchý reproduktorový systém známý z klasických Macintoshů. Pro ukládání dat byl vybaven 40MB nebo 80MB SCSI pevným diskem a 1,44MB disketovou mechanikou.